MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 3792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009955	TCC	2	6	2	7	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009955	GGTCA	2	10	77	86	20 %	20 %	40 %	20 %	159046136
3	NC_009955	GCG	2	6	183	188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046136
4	NC_009955	TTCGC	2	10	374	383	0 %	40 %	20 %	40 %	159046136
5	NC_009955	GTC	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046136
6	NC_009955	CG	3	6	487	492	0 %	0 %	50 %	50 %	159046136
7	NC_009955	ATG	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046136
8	NC_009955	GTG	2	6	536	541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046136
9	NC_009955	GC	3	6	552	557	0 %	0 %	50 %	50 %	159046136
10	NC_009955	CCAG	2	8	595	602	25 %	0 %	25 %	50 %	159046136
11	NC_009955	CGC	2	6	608	613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046136
12	NC_009955	ACA	2	6	673	678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046136
13	NC_009955	AGA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046136
14	NC_009955	GAAC	2	8	787	794	50 %	0 %	25 %	25 %	159046136
15	NC_009955	ATC	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046136
16	NC_009955	AGT	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046136
17	NC_009955	CCT	2	6	854	859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009955	ACA	3	9	876	884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009955	CAA	2	6	933	938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009955	CGT	2	6	944	949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009955	CTT	2	6	966	971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009955	GAG	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009955	ACGAG	2	10	1036	1045	40 %	0 %	40 %	20 %	159046137
24	NC_009955	CGT	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046137
25	NC_009955	CGT	2	6	1179	1184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046137
26	NC_009955	CGA	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046137
27	NC_009955	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	159046137
28	NC_009955	CGGGGT	2	12	1239	1250	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159046137
29	NC_009955	GC	3	6	1291	1296	0 %	0 %	50 %	50 %	159046137
30	NC_009955	TGG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046137
31	NC_009955	AACG	2	8	1323	1330	50 %	0 %	25 %	25 %	159046137
32	NC_009955	AAC	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046137
33	NC_009955	CG	3	6	1411	1416	0 %	0 %	50 %	50 %	159046137
34	NC_009955	GAAC	2	8	1466	1473	50 %	0 %	25 %	25 %	159046137
35	NC_009955	GC	3	6	1511	1516	0 %	0 %	50 %	50 %	159046137
36	NC_009955	GAG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046137
37	NC_009955	TCAT	2	8	1678	1685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009955	GCTG	2	8	1742	1749	0 %	25 %	50 %	25 %	159046138
39	NC_009955	CAG	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
40	NC_009955	AC	3	6	1770	1775	50 %	0 %	0 %	50 %	159046138
41	NC_009955	ACG	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
42	NC_009955	GGT	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046138
43	NC_009955	CCGC	2	8	1891	1898	0 %	0 %	25 %	75 %	159046138
44	NC_009955	GGA	2	6	1919	1924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046138
45	NC_009955	GGAT	2	8	1966	1973	25 %	25 %	50 %	0 %	159046138
46	NC_009955	CTCA	2	8	1986	1993	25 %	25 %	0 %	50 %	159046138
47	NC_009955	TCG	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046138
48	NC_009955	GTT	2	6	2160	2165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046138
49	NC_009955	TTC	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046138
50	NC_009955	ACG	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
51	NC_009955	CGA	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
52	NC_009955	GCCC	2	8	2603	2610	0 %	0 %	25 %	75 %	159046138
53	NC_009955	GCCT	2	8	2710	2717	0 %	25 %	25 %	50 %	159046138
54	NC_009955	CCG	2	6	2734	2739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046138
55	NC_009955	GAC	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
56	NC_009955	CG	3	6	2753	2758	0 %	0 %	50 %	50 %	159046138
57	NC_009955	CCA	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046138
58	NC_009955	GCG	2	6	2832	2837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046138
59	NC_009955	TCG	2	6	2899	2904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046138
60	NC_009955	TGC	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046138
61	NC_009955	CCA	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046138
62	NC_009955	ATAC	2	8	3006	3013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009955	TC	3	6	3125	3130	0 %	50 %	0 %	50 %	159046139
64	NC_009955	GCG	2	6	3140	3145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046139
65	NC_009955	GCC	2	6	3155	3160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046139
66	NC_009955	TGG	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046139
67	NC_009955	CTT	2	6	3384	3389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046139
68	NC_009955	TGC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046139
69	NC_009955	CTTG	2	8	3545	3552	0 %	50 %	25 %	25 %	159046139
70	NC_009955	TGGT	2	8	3557	3564	0 %	50 %	50 %	0 %	159046139
71	NC_009955	ACAA	2	8	3641	3648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009955	GCTTC	2	10	3652	3661	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_009955	GAC	2	6	3672	3677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046140
74	NC_009955	AGC	2	6	3763	3768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046140
75	NC_009955	CGCC	2	8	3786	3793	0 %	0 %	25 %	75 %	159046140
76	NC_009955	CAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046140
77	NC_009955	GCT	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046140
78	NC_009955	CG	3	6	3904	3909	0 %	0 %	50 %	50 %	159046140
79	NC_009955	CCG	2	6	4003	4008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046140
80	NC_009955	CAA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046140
81	NC_009955	GCA	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046140
82	NC_009955	TCG	2	6	4140	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046140
83	NC_009955	GCA	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046140
84	NC_009955	GGC	2	6	4199	4204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046140
85	NC_009955	TGCG	2	8	4220	4227	0 %	25 %	50 %	25 %	159046140
86	NC_009955	CGT	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009955	TTG	2	6	4389	4394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009955	GTC	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046141
89	NC_009955	A	6	6	4533	4538	100 %	0 %	0 %	0 %	159046141
90	NC_009955	GAC	2	6	4686	4691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046141
91	NC_009955	GCT	2	6	4842	4847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046141
92	NC_009955	TGT	2	6	4868	4873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046141
93	NC_009955	TGA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046141
94	NC_009955	GCACC	2	10	4972	4981	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_009955	CCT	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009955	TTCGGT	2	12	5141	5152	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009955	T	7	7	5175	5181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009955	C	6	6	5314	5319	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_009955	ATG	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
100	NC_009955	GGT	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046142
101	NC_009955	ATG	2	6	5503	5508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
102	NC_009955	ATG	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
103	NC_009955	ATG	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
104	NC_009955	ATG	2	6	5557	5562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
105	NC_009955	ATG	2	6	5572	5577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
106	NC_009955	ATG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
107	NC_009955	TGGC	2	8	5615	5622	0 %	25 %	50 %	25 %	159046142
108	NC_009955	ATG	2	6	5626	5631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
109	NC_009955	ACG	2	6	5662	5667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046142
110	NC_009955	GAA	2	6	5671	5676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046142
111	NC_009955	GAT	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
112	NC_009955	ATG	2	6	5782	5787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
113	NC_009955	GAT	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
114	NC_009955	ATG	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
115	NC_009955	T	7	7	5983	5989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009955	GAACC	2	10	6037	6046	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_009955	CAA	2	6	6076	6081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009955	GGAAA	2	10	6092	6101	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009955	CTGA	2	8	6204	6211	25 %	25 %	25 %	25 %	159046143
120	NC_009955	CGA	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046143
121	NC_009955	GCC	2	6	6257	6262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046143
122	NC_009955	ATCGAG	2	12	6309	6320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159046143
123	NC_009955	TGA	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009955	TGC	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046144
125	NC_009955	G	7	7	6660	6666	0 %	0 %	100 %	0 %	159046144
126	NC_009955	TGGC	2	8	6719	6726	0 %	25 %	50 %	25 %	159046144
127	NC_009955	CCG	2	6	6777	6782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046144
128	NC_009955	TCT	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046144
129	NC_009955	ATC	3	9	6819	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046144
130	NC_009955	TGG	2	6	6839	6844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046144
131	NC_009955	GGC	2	6	6921	6926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046144
132	NC_009955	G	6	6	6939	6944	0 %	0 %	100 %	0 %	159046144
133	NC_009955	ACC	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046144
134	NC_009955	CAA	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046144
135	NC_009955	GCTG	2	8	7255	7262	0 %	25 %	50 %	25 %	159046144
136	NC_009955	TGGC	2	8	7279	7286	0 %	25 %	50 %	25 %	159046144
137	NC_009955	TCG	2	6	7321	7326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046144
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266	NC_009955	CAT	2	6	13787	13792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_009955	GTG	2	6	13949	13954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046150
268	NC_009955	GCA	2	6	13970	13975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046150
269	NC_009955	GCC	2	6	14020	14025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046150
270	NC_009955	GTC	2	6	14026	14031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046150
271	NC_009955	CAGC	2	8	14048	14055	25 %	0 %	25 %	50 %	159046150
272	NC_009955	CGTTT	2	10	14085	14094	0 %	60 %	20 %	20 %	159046150
273	NC_009955	CTCA	2	8	14107	14114	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
274	NC_009955	CGT	2	6	14153	14158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_009955	GGC	2	6	14167	14172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_009955	TTG	2	6	14221	14226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_009955	GAC	2	6	14572	14577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046151
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279	NC_009955	GGC	2	6	14652	14657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046151
280	NC_009955	GCG	2	6	14693	14698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046151
281	NC_009955	GCG	2	6	14707	14712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046151
282	NC_009955	GCG	2	6	14747	14752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046151
283	NC_009955	TGCCTA	2	12	14783	14794	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046151
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286	NC_009955	T	6	6	14941	14946	0 %	100 %	0 %	0 %	159046151
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290	NC_009955	CTC	2	6	15034	15039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046151
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296	NC_009955	CGA	2	6	15243	15248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046151
297	NC_009955	CGA	2	6	15296	15301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046151
298	NC_009955	GCC	2	6	15304	15309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046151
299	NC_009955	TGG	2	6	15341	15346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046151
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301	NC_009955	CG	3	6	15364	15369	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
302	NC_009955	GTGG	2	8	15381	15388	0 %	25 %	75 %	0 %	159046151
303	NC_009955	CG	3	6	15396	15401	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
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342	NC_009955	CAC	2	6	16917	16922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
343	NC_009955	GGA	2	6	17127	17132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046153
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354	NC_009955	CG	3	6	17492	17497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
355	NC_009955	GGA	2	6	17647	17652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046154
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382	NC_009955	GGC	2	6	18787	18792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046155
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392	NC_009955	GC	3	6	19124	19129	0 %	0 %	50 %	50 %	159046155
393	NC_009955	CGG	2	6	19201	19206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046155
394	NC_009955	CCG	2	6	19226	19231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046155
395	NC_009955	GCA	2	6	19232	19237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046155
396	NC_009955	AGC	3	9	19345	19353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046156
397	NC_009955	CGC	2	6	19358	19363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046156
398	NC_009955	AGGC	2	8	19391	19398	25 %	0 %	50 %	25 %	159046156
399	NC_009955	CCG	2	6	19480	19485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046156
400	NC_009955	GCT	2	6	19518	19523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046156
401	NC_009955	GCCA	2	8	19543	19550	25 %	0 %	25 %	50 %	159046156
402	NC_009955	CCA	2	6	19584	19589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046156
403	NC_009955	GC	3	6	19592	19597	0 %	0 %	50 %	50 %	159046156
404	NC_009955	GCA	2	6	19741	19746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046156
405	NC_009955	CGA	2	6	19754	19759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046156
406	NC_009955	TCA	2	6	19772	19777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046156
407	NC_009955	CCAG	2	8	19785	19792	25 %	0 %	25 %	50 %	159046157
408	NC_009955	AAC	2	6	19802	19807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046157
409	NC_009955	TGA	2	6	19890	19895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046157
410	NC_009955	CTG	2	6	19911	19916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046157
411	NC_009955	GCA	2	6	19935	19940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046157
412	NC_009955	CGA	2	6	19992	19997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046157
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415	NC_009955	CCCG	2	8	20119	20126	0 %	0 %	25 %	75 %	159046157
416	NC_009955	CCGACG	2	12	20147	20158	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159046157
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419	NC_009955	GCG	2	6	20225	20230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046157
420	NC_009955	CGTT	2	8	20273	20280	0 %	50 %	25 %	25 %	159046157
421	NC_009955	GCC	2	6	20330	20335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046157
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423	NC_009955	GAA	2	6	20395	20400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046157
424	NC_009955	CGC	2	6	20422	20427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046157
425	NC_009955	AGC	2	6	20435	20440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046157
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427	NC_009955	CGGGA	2	10	20456	20465	20 %	0 %	60 %	20 %	159046157
428	NC_009955	CGG	2	6	20511	20516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046157
429	NC_009955	TCAG	2	8	20585	20592	25 %	25 %	25 %	25 %	159046158
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433	NC_009955	TCC	2	6	20864	20869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046158
434	NC_009955	CAGCCG	2	12	20934	20945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159046158
435	NC_009955	GTC	2	6	21063	21068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046159
436	NC_009955	AAG	2	6	21098	21103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046159
437	NC_009955	GTC	2	6	21140	21145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046159
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482	NC_009955	CTT	2	6	23502	23507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046161
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500	NC_009955	CGG	2	6	24383	24388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046163

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